Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGZ3

Dcaf12, DDB1- and CUL4-associated factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dcaf12Q8BGZ3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dcaf12Q8BGZ3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms