Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW3

Bhlhe23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe23Q8BGW3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlhe23Q8BGW3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlhe23Q8BGW3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlhe23Q8BGW3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlhe23Q8BGW3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlhe23Q8BGW3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlhe23Q8BGW3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlhe23Q8BGW3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlhe23Q8BGW3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlhe23Q8BGW3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlhe23Q8BGW3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlhe23Q8BGW3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlhe23Q8BGW3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlhe23Q8BGW3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlhe23Q8BGW3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlhe23Q8BGW3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlhe23Q8BGW3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlhe23Q8BGW3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms