Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms