Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGM5

Best2, Bestrophin-2, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best2Q8BGM5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Best2Q8BGM5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Best2Q8BGM5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Best2Q8BGM5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Best2Q8BGM5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Best2Q8BGM5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Best2Q8BGM5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Best2Q8BGM5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Best2Q8BGM5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Best2Q8BGM5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Best2Q8BGM5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Best2Q8BGM5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Best2Q8BGM5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Best2Q8BGM5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Best2Q8BGM5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Best2Q8BGM5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Best2Q8BGM5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Best2Q8BGM5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Best2Q8BGM5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Best2Q8BGM5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Best2Q8BGM5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Best2Q8BGM5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Best2Q8BGM5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Best2Q8BGM5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Best2Q8BGM5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Best2Q8BGM5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Best2Q8BGM5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Best2Q8BGM5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Best2Q8BGM5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Best2Q8BGM5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Best2Q8BGM5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Best2Q8BGM5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Best2Q8BGM5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Best2Q8BGM5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Best2Q8BGM5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Best2Q8BGM5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Best2Q8BGM5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Best2Q8BGM5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Best2Q8BGM5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Best2Q8BGM5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Best2Q8BGM5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Best2Q8BGM5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Best2Q8BGM5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Best2Q8BGM5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Best2Q8BGM5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Best2Q8BGM5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Best2Q8BGM5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Best2Q8BGM5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Best2Q8BGM5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Best2Q8BGM5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Best2Q8BGM5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Best2Q8BGM5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Best2Q8BGM5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Best2Q8BGM5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Best2Q8BGM5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Best2Q8BGM5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Best2Q8BGM5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Best2Q8BGM5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Best2Q8BGM5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Best2Q8BGM5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Best2Q8BGM5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Best2Q8BGM5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Best2Q8BGM5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Best2Q8BGM5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Best2Q8BGM5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Best2Q8BGM5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Best2Q8BGM5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Best2Q8BGM5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Best2Q8BGM5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Best2Q8BGM5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Best2Q8BGM5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Best2Q8BGM5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Best2Q8BGM5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Best2Q8BGM5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Best2Q8BGM5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Best2Q8BGM5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Best2Q8BGM5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Best2Q8BGM5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Best2Q8BGM5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Best2Q8BGM5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Best2Q8BGM5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Best2Q8BGM5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Best2Q8BGM5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Best2Q8BGM5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Best2Q8BGM5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Best2Q8BGM5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Best2Q8BGM5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Best2Q8BGM5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Best2Q8BGM5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Best2Q8BGM5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Best2Q8BGM5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Best2Q8BGM5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Best2Q8BGM5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Best2Q8BGM5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Best2Q8BGM5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Best2Q8BGM5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Best2Q8BGM5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Best2Q8BGM5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Best2Q8BGM5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Best2Q8BGM5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms