Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms