Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG07

Pld4, Phospholipase D4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pld4Q8BG07 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms