Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFT9

Svop, Synaptic vesicle 2-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvopQ8BFT9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SvopQ8BFT9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SvopQ8BFT9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SvopQ8BFT9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SvopQ8BFT9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SvopQ8BFT9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SvopQ8BFT9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SvopQ8BFT9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SvopQ8BFT9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SvopQ8BFT9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SvopQ8BFT9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SvopQ8BFT9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms