Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFT6

Jmjd4, JmjC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd4Q8BFT6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Jmjd4Q8BFT6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Jmjd4Q8BFT6 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Jmjd4Q8BFT6 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Jmjd4Q8BFT6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Jmjd4Q8BFT6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Jmjd4Q8BFT6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Jmjd4Q8BFT6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Jmjd4Q8BFT6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Jmjd4Q8BFT6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Jmjd4Q8BFT6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Jmjd4Q8BFT6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Jmjd4Q8BFT6 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Jmjd4Q8BFT6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Jmjd4Q8BFT6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Jmjd4Q8BFT6 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Jmjd4Q8BFT6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Jmjd4Q8BFT6 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Jmjd4Q8BFT6 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Jmjd4Q8BFT6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Jmjd4Q8BFT6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Jmjd4Q8BFT6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Jmjd4Q8BFT6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Jmjd4Q8BFT6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Jmjd4Q8BFT6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Jmjd4Q8BFT6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Jmjd4Q8BFT6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Jmjd4Q8BFT6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Jmjd4Q8BFT6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Jmjd4Q8BFT6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Jmjd4Q8BFT6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Jmjd4Q8BFT6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Jmjd4Q8BFT6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Jmjd4Q8BFT6 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Jmjd4Q8BFT6 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Jmjd4Q8BFT6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Jmjd4Q8BFT6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Jmjd4Q8BFT6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Jmjd4Q8BFT6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Jmjd4Q8BFT6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Jmjd4Q8BFT6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Jmjd4Q8BFT6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Jmjd4Q8BFT6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Jmjd4Q8BFT6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Jmjd4Q8BFT6 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Jmjd4Q8BFT6 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Jmjd4Q8BFT6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Jmjd4Q8BFT6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Jmjd4Q8BFT6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Jmjd4Q8BFT6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Jmjd4Q8BFT6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Jmjd4Q8BFT6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Jmjd4Q8BFT6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Jmjd4Q8BFT6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Jmjd4Q8BFT6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Jmjd4Q8BFT6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Jmjd4Q8BFT6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Jmjd4Q8BFT6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Jmjd4Q8BFT6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Jmjd4Q8BFT6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Jmjd4Q8BFT6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Jmjd4Q8BFT6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Jmjd4Q8BFT6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Jmjd4Q8BFT6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Jmjd4Q8BFT6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Jmjd4Q8BFT6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Jmjd4Q8BFT6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Jmjd4Q8BFT6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Jmjd4Q8BFT6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Jmjd4Q8BFT6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Jmjd4Q8BFT6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Jmjd4Q8BFT6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Jmjd4Q8BFT6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Jmjd4Q8BFT6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Jmjd4Q8BFT6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Jmjd4Q8BFT6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Jmjd4Q8BFT6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Jmjd4Q8BFT6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Jmjd4Q8BFT6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Jmjd4Q8BFT6 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Jmjd4Q8BFT6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Jmjd4Q8BFT6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Jmjd4Q8BFT6 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Jmjd4Q8BFT6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Jmjd4Q8BFT6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Jmjd4Q8BFT6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Jmjd4Q8BFT6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Jmjd4Q8BFT6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Jmjd4Q8BFT6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Jmjd4Q8BFT6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Jmjd4Q8BFT6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Jmjd4Q8BFT6 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Jmjd4Q8BFT6 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Jmjd4Q8BFT6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Jmjd4Q8BFT6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Jmjd4Q8BFT6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Jmjd4Q8BFT6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Jmjd4Q8BFT6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Jmjd4Q8BFT6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Jmjd4Q8BFT6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms