Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M10.4Q85ZW8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-M10.4Q85ZW8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-M10.4Q85ZW8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-M10.4Q85ZW8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-M10.4Q85ZW8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-M10.4Q85ZW8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-M10.4Q85ZW8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-M10.4Q85ZW8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms