Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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