Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Smim19Q80ZU4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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