Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Amigo1Q80ZD8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Amigo1Q80ZD8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Amigo1Q80ZD8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Amigo1Q80ZD8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Amigo1Q80ZD8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Amigo1Q80ZD8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Amigo1Q80ZD8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Amigo1Q80ZD8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Amigo1Q80ZD8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Amigo1Q80ZD8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Amigo1Q80ZD8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Amigo1Q80ZD8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Amigo1Q80ZD8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Amigo1Q80ZD8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Amigo1Q80ZD8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Amigo1Q80ZD8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Amigo1Q80ZD8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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