Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z71

Tnn, Tenascin-N, mousemouse

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnnQ80Z71 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TnnQ80Z71 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TnnQ80Z71 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TnnQ80Z71 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TnnQ80Z71 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TnnQ80Z71 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TnnQ80Z71 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TnnQ80Z71 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TnnQ80Z71 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TnnQ80Z71 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TnnQ80Z71 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TnnQ80Z71 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TnnQ80Z71 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TnnQ80Z71 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TnnQ80Z71 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TnnQ80Z71 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TnnQ80Z71 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TnnQ80Z71 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TnnQ80Z71 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TnnQ80Z71 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TnnQ80Z71 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TnnQ80Z71 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TnnQ80Z71 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TnnQ80Z71 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TnnQ80Z71 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TnnQ80Z71 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TnnQ80Z71 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TnnQ80Z71 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TnnQ80Z71 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TnnQ80Z71 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TnnQ80Z71 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TnnQ80Z71 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TnnQ80Z71 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TnnQ80Z71 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TnnQ80Z71 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TnnQ80Z71 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TnnQ80Z71 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TnnQ80Z71 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TnnQ80Z71 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TnnQ80Z71 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TnnQ80Z71 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TnnQ80Z71 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TnnQ80Z71 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TnnQ80Z71 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TnnQ80Z71 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TnnQ80Z71 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TnnQ80Z71 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TnnQ80Z71 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TnnQ80Z71 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TnnQ80Z71 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TnnQ80Z71 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TnnQ80Z71 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TnnQ80Z71 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TnnQ80Z71 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TnnQ80Z71 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TnnQ80Z71 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TnnQ80Z71 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TnnQ80Z71 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TnnQ80Z71 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TnnQ80Z71 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TnnQ80Z71 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TnnQ80Z71 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TnnQ80Z71 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TnnQ80Z71 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TnnQ80Z71 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TnnQ80Z71 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TnnQ80Z71 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TnnQ80Z71 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TnnQ80Z71 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TnnQ80Z71 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TnnQ80Z71 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TnnQ80Z71 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TnnQ80Z71 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TnnQ80Z71 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TnnQ80Z71 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TnnQ80Z71 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TnnQ80Z71 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TnnQ80Z71 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TnnQ80Z71 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TnnQ80Z71 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TnnQ80Z71 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TnnQ80Z71 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TnnQ80Z71 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TnnQ80Z71 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TnnQ80Z71 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TnnQ80Z71 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TnnQ80Z71 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TnnQ80Z71 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TnnQ80Z71 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TnnQ80Z71 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TnnQ80Z71 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TnnQ80Z71 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TnnQ80Z71 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TnnQ80Z71 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TnnQ80Z71 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TnnQ80Z71 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TnnQ80Z71 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TnnQ80Z71 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TnnQ80Z71 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TnnQ80Z71 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms