Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Atg2bQ80XK6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Atg2bQ80XK6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Atg2bQ80XK6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg2bQ80XK6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg2bQ80XK6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg2bQ80XK6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg2bQ80XK6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg2bQ80XK6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg2bQ80XK6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg2bQ80XK6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg2bQ80XK6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg2bQ80XK6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg2bQ80XK6 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg2bQ80XK6 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg2bQ80XK6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg2bQ80XK6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg2bQ80XK6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg2bQ80XK6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg2bQ80XK6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg2bQ80XK6 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg2bQ80XK6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg2bQ80XK6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg2bQ80XK6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg2bQ80XK6 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg2bQ80XK6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg2bQ80XK6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg2bQ80XK6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg2bQ80XK6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg2bQ80XK6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg2bQ80XK6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg2bQ80XK6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg2bQ80XK6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg2bQ80XK6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg2bQ80XK6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg2bQ80XK6 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg2bQ80XK6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg2bQ80XK6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg2bQ80XK6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg2bQ80XK6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg2bQ80XK6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg2bQ80XK6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg2bQ80XK6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg2bQ80XK6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg2bQ80XK6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg2bQ80XK6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg2bQ80XK6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg2bQ80XK6 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg2bQ80XK6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg2bQ80XK6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg2bQ80XK6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg2bQ80XK6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg2bQ80XK6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg2bQ80XK6 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg2bQ80XK6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg2bQ80XK6 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg2bQ80XK6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg2bQ80XK6 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg2bQ80XK6 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg2bQ80XK6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg2bQ80XK6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg2bQ80XK6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg2bQ80XK6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg2bQ80XK6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg2bQ80XK6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg2bQ80XK6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg2bQ80XK6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg2bQ80XK6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg2bQ80XK6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg2bQ80XK6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg2bQ80XK6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg2bQ80XK6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg2bQ80XK6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg2bQ80XK6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms