Protein–RNA interactions for Protein: Q80W40

Acsm4, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM4, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsm4Q80W40 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acsm4Q80W40 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acsm4Q80W40 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acsm4Q80W40 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acsm4Q80W40 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acsm4Q80W40 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acsm4Q80W40 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acsm4Q80W40 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acsm4Q80W40 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acsm4Q80W40 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acsm4Q80W40 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acsm4Q80W40 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acsm4Q80W40 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acsm4Q80W40 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acsm4Q80W40 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acsm4Q80W40 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acsm4Q80W40 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acsm4Q80W40 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Acsm4Q80W40 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Acsm4Q80W40 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Acsm4Q80W40 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Acsm4Q80W40 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Acsm4Q80W40 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms