Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SnupnQ80W37 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SnupnQ80W37 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SnupnQ80W37 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SnupnQ80W37 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SnupnQ80W37 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SnupnQ80W37 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SnupnQ80W37 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SnupnQ80W37 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SnupnQ80W37 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SnupnQ80W37 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SnupnQ80W37 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SnupnQ80W37 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SnupnQ80W37 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SnupnQ80W37 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SnupnQ80W37 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SnupnQ80W37 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SnupnQ80W37 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SnupnQ80W37 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SnupnQ80W37 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SnupnQ80W37 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SnupnQ80W37 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SnupnQ80W37 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SnupnQ80W37 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SnupnQ80W37 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SnupnQ80W37 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SnupnQ80W37 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SnupnQ80W37 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SnupnQ80W37 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SnupnQ80W37 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SnupnQ80W37 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnupnQ80W37 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnupnQ80W37 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnupnQ80W37 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnupnQ80W37 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SnupnQ80W37 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SnupnQ80W37 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnupnQ80W37 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnupnQ80W37 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnupnQ80W37 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnupnQ80W37 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnupnQ80W37 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnupnQ80W37 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnupnQ80W37 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnupnQ80W37 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnupnQ80W37 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnupnQ80W37 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnupnQ80W37 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnupnQ80W37 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnupnQ80W37 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnupnQ80W37 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnupnQ80W37 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnupnQ80W37 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnupnQ80W37 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnupnQ80W37 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SnupnQ80W37 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SnupnQ80W37 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SnupnQ80W37 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SnupnQ80W37 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SnupnQ80W37 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SnupnQ80W37 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SnupnQ80W37 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SnupnQ80W37 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SnupnQ80W37 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SnupnQ80W37 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SnupnQ80W37 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SnupnQ80W37 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SnupnQ80W37 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SnupnQ80W37 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SnupnQ80W37 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SnupnQ80W37 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SnupnQ80W37 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SnupnQ80W37 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SnupnQ80W37 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SnupnQ80W37 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SnupnQ80W37 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SnupnQ80W37 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SnupnQ80W37 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SnupnQ80W37 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SnupnQ80W37 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SnupnQ80W37 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SnupnQ80W37 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SnupnQ80W37 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SnupnQ80W37 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SnupnQ80W37 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SnupnQ80W37 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SnupnQ80W37 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SnupnQ80W37 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SnupnQ80W37 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SnupnQ80W37 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SnupnQ80W37 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SnupnQ80W37 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SnupnQ80W37 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SnupnQ80W37 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SnupnQ80W37 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SnupnQ80W37 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SnupnQ80W37 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SnupnQ80W37 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SnupnQ80W37 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SnupnQ80W37 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms