Protein–RNA interactions for Protein: Q80VJ8

Ccdc155, Protein KASH5, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc155Q80VJ8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc155Q80VJ8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc155Q80VJ8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc155Q80VJ8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc155Q80VJ8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc155Q80VJ8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc155Q80VJ8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc155Q80VJ8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc155Q80VJ8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc155Q80VJ8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc155Q80VJ8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc155Q80VJ8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc155Q80VJ8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc155Q80VJ8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc155Q80VJ8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc155Q80VJ8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc155Q80VJ8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc155Q80VJ8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc155Q80VJ8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc155Q80VJ8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc155Q80VJ8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc155Q80VJ8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc155Q80VJ8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc155Q80VJ8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc155Q80VJ8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc155Q80VJ8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc155Q80VJ8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc155Q80VJ8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc155Q80VJ8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc155Q80VJ8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms