Protein–RNA interactions for Protein: Q80V24

Vgll4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll4Q80V24 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vgll4Q80V24 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vgll4Q80V24 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vgll4Q80V24 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vgll4Q80V24 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vgll4Q80V24 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vgll4Q80V24 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vgll4Q80V24 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vgll4Q80V24 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vgll4Q80V24 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vgll4Q80V24 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vgll4Q80V24 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vgll4Q80V24 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vgll4Q80V24 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vgll4Q80V24 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vgll4Q80V24 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vgll4Q80V24 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vgll4Q80V24 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vgll4Q80V24 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vgll4Q80V24 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vgll4Q80V24 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vgll4Q80V24 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vgll4Q80V24 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vgll4Q80V24 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vgll4Q80V24 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vgll4Q80V24 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vgll4Q80V24 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vgll4Q80V24 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vgll4Q80V24 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms