Protein–RNA interactions for Protein: Q80UW8

Polr2e, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2eQ80UW8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr2eQ80UW8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr2eQ80UW8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr2eQ80UW8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr2eQ80UW8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr2eQ80UW8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr2eQ80UW8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr2eQ80UW8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr2eQ80UW8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr2eQ80UW8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr2eQ80UW8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr2eQ80UW8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr2eQ80UW8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr2eQ80UW8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr2eQ80UW8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr2eQ80UW8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr2eQ80UW8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr2eQ80UW8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr2eQ80UW8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr2eQ80UW8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr2eQ80UW8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr2eQ80UW8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr2eQ80UW8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr2eQ80UW8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr2eQ80UW8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr2eQ80UW8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr2eQ80UW8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr2eQ80UW8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr2eQ80UW8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr2eQ80UW8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr2eQ80UW8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr2eQ80UW8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr2eQ80UW8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr2eQ80UW8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr2eQ80UW8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr2eQ80UW8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr2eQ80UW8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr2eQ80UW8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr2eQ80UW8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr2eQ80UW8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr2eQ80UW8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr2eQ80UW8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr2eQ80UW8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr2eQ80UW8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr2eQ80UW8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr2eQ80UW8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr2eQ80UW8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr2eQ80UW8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr2eQ80UW8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr2eQ80UW8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr2eQ80UW8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr2eQ80UW8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Polr2eQ80UW8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Polr2eQ80UW8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Polr2eQ80UW8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Polr2eQ80UW8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Polr2eQ80UW8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr2eQ80UW8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr2eQ80UW8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr2eQ80UW8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr2eQ80UW8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr2eQ80UW8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr2eQ80UW8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr2eQ80UW8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr2eQ80UW8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr2eQ80UW8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr2eQ80UW8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr2eQ80UW8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr2eQ80UW8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr2eQ80UW8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr2eQ80UW8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr2eQ80UW8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr2eQ80UW8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr2eQ80UW8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr2eQ80UW8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr2eQ80UW8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr2eQ80UW8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr2eQ80UW8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr2eQ80UW8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr2eQ80UW8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr2eQ80UW8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr2eQ80UW8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr2eQ80UW8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr2eQ80UW8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr2eQ80UW8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr2eQ80UW8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr2eQ80UW8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr2eQ80UW8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr2eQ80UW8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr2eQ80UW8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr2eQ80UW8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr2eQ80UW8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr2eQ80UW8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr2eQ80UW8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr2eQ80UW8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr2eQ80UW8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr2eQ80UW8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr2eQ80UW8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr2eQ80UW8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr2eQ80UW8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms