Protein–RNA interactions for Protein: Q80UG2

Plxna4, Plexin-A4, mousemouse

Predictions only

Length 1,893 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna4Q80UG2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Plxna4Q80UG2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms