Protein–RNA interactions for Protein: Q80UB0

Testin-2, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q80UB0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q80UB0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q80UB0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q80UB0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q80UB0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q80UB0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q80UB0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q80UB0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q80UB0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q80UB0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q80UB0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q80UB0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q80UB0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q80UB0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q80UB0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q80UB0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q80UB0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q80UB0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q80UB0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q80UB0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q80UB0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q80UB0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q80UB0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q80UB0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q80UB0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q80UB0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q80UB0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q80UB0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q80UB0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q80UB0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q80UB0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q80UB0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q80UB0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q80UB0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q80UB0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q80UB0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q80UB0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q80UB0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q80UB0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q80UB0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q80UB0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q80UB0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q80UB0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q80UB0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q80UB0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q80UB0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q80UB0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q80UB0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q80UB0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q80UB0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q80UB0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q80UB0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q80UB0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q80UB0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q80UB0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q80UB0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q80UB0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q80UB0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q80UB0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q80UB0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q80UB0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q80UB0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q80UB0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q80UB0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q80UB0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q80UB0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q80UB0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q80UB0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q80UB0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q80UB0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q80UB0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q80UB0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q80UB0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q80UB0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q80UB0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q80UB0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q80UB0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q80UB0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q80UB0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q80UB0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q80UB0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q80UB0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q80UB0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q80UB0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q80UB0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q80UB0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q80UB0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q80UB0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q80UB0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q80UB0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q80UB0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q80UB0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q80UB0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q80UB0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q80UB0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q80UB0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q80UB0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q80UB0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q80UB0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q80UB0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms