Protein–RNA interactions for Protein: Q80U35

Arhgef17, Rho guanine nucleotide exchange factor 17, mousemouse

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Length 2,057 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef17Q80U35 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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Arhgef17Q80U35 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Arhgef17Q80U35 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arhgef17Q80U35 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arhgef17Q80U35 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arhgef17Q80U35 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arhgef17Q80U35 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arhgef17Q80U35 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arhgef17Q80U35 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arhgef17Q80U35 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Arhgef17Q80U35 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Arhgef17Q80U35 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Arhgef17Q80U35 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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