Protein–RNA interactions for Protein: Q80TT8

Cul9, Cullin-9, mousemouse

Predictions only

Length 1,865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul9Q80TT8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cul9Q80TT8 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cul9Q80TT8 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Cul9Q80TT8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cul9Q80TT8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cul9Q80TT8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cul9Q80TT8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cul9Q80TT8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cul9Q80TT8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cul9Q80TT8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cul9Q80TT8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cul9Q80TT8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cul9Q80TT8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cul9Q80TT8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cul9Q80TT8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cul9Q80TT8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cul9Q80TT8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cul9Q80TT8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cul9Q80TT8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cul9Q80TT8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cul9Q80TT8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cul9Q80TT8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cul9Q80TT8 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Cul9Q80TT8 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Cul9Q80TT8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cul9Q80TT8 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cul9Q80TT8 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cul9Q80TT8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Cul9Q80TT8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cul9Q80TT8 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cul9Q80TT8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cul9Q80TT8 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Cul9Q80TT8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cul9Q80TT8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cul9Q80TT8 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cul9Q80TT8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cul9Q80TT8 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cul9Q80TT8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cul9Q80TT8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cul9Q80TT8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cul9Q80TT8 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cul9Q80TT8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Cul9Q80TT8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cul9Q80TT8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cul9Q80TT8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cul9Q80TT8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cul9Q80TT8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Cul9Q80TT8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cul9Q80TT8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cul9Q80TT8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cul9Q80TT8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cul9Q80TT8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cul9Q80TT8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cul9Q80TT8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cul9Q80TT8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cul9Q80TT8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cul9Q80TT8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cul9Q80TT8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cul9Q80TT8 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Cul9Q80TT8 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Cul9Q80TT8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cul9Q80TT8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cul9Q80TT8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cul9Q80TT8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cul9Q80TT8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cul9Q80TT8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cul9Q80TT8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cul9Q80TT8 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cul9Q80TT8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cul9Q80TT8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cul9Q80TT8 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Cul9Q80TT8 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Cul9Q80TT8 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Cul9Q80TT8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cul9Q80TT8 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Cul9Q80TT8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cul9Q80TT8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cul9Q80TT8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cul9Q80TT8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cul9Q80TT8 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cul9Q80TT8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Cul9Q80TT8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cul9Q80TT8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cul9Q80TT8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cul9Q80TT8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cul9Q80TT8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cul9Q80TT8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cul9Q80TT8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cul9Q80TT8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cul9Q80TT8 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cul9Q80TT8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cul9Q80TT8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Cul9Q80TT8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cul9Q80TT8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cul9Q80TT8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cul9Q80TT8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cul9Q80TT8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cul9Q80TT8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cul9Q80TT8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cul9Q80TT8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms