Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
NischQ80TM9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
NischQ80TM9 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
NischQ80TM9 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
NischQ80TM9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
NischQ80TM9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
NischQ80TM9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
NischQ80TM9 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
NischQ80TM9 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
NischQ80TM9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
NischQ80TM9 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
NischQ80TM9 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
NischQ80TM9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
NischQ80TM9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
NischQ80TM9 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
NischQ80TM9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
NischQ80TM9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
NischQ80TM9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
NischQ80TM9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
NischQ80TM9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
NischQ80TM9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
NischQ80TM9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
NischQ80TM9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
NischQ80TM9 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
NischQ80TM9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
NischQ80TM9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC36.17■■■■□ 3.38
NischQ80TM9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
NischQ80TM9 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
NischQ80TM9 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
NischQ80TM9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
NischQ80TM9 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
NischQ80TM9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
NischQ80TM9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
NischQ80TM9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
NischQ80TM9 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
NischQ80TM9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
NischQ80TM9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
NischQ80TM9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC36.15■■■■□ 3.38
NischQ80TM9 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
NischQ80TM9 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
NischQ80TM9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
NischQ80TM9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
NischQ80TM9 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
NischQ80TM9 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
NischQ80TM9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
NischQ80TM9 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
NischQ80TM9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
NischQ80TM9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
NischQ80TM9 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
NischQ80TM9 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
NischQ80TM9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
NischQ80TM9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC36.13■■■■□ 3.37
NischQ80TM9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
NischQ80TM9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
NischQ80TM9 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
NischQ80TM9 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
NischQ80TM9 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
NischQ80TM9 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
NischQ80TM9 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
NischQ80TM9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
NischQ80TM9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
NischQ80TM9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
NischQ80TM9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
NischQ80TM9 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
NischQ80TM9 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
NischQ80TM9 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
NischQ80TM9 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
NischQ80TM9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
NischQ80TM9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
NischQ80TM9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
NischQ80TM9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
NischQ80TM9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
NischQ80TM9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
NischQ80TM9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
NischQ80TM9 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
NischQ80TM9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
NischQ80TM9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
NischQ80TM9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
NischQ80TM9 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
NischQ80TM9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
NischQ80TM9 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
NischQ80TM9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
NischQ80TM9 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
NischQ80TM9 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
NischQ80TM9 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
NischQ80TM9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
NischQ80TM9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
NischQ80TM9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
NischQ80TM9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
NischQ80TM9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
NischQ80TM9 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
NischQ80TM9 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
NischQ80TM9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
NischQ80TM9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
NischQ80TM9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
NischQ80TM9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
NischQ80TM9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
NischQ80TM9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
NischQ80TM9 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.37
NischQ80TM9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
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