Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms