Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms