Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms