Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSL0

Ifnk, Interferon kappa, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnkQ7TSL0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms