Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPQ3

Shprh, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, mousemouse

Predictions only

Length 1,674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShprhQ7TPQ3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ShprhQ7TPQ3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ShprhQ7TPQ3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ShprhQ7TPQ3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ShprhQ7TPQ3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ShprhQ7TPQ3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ShprhQ7TPQ3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ShprhQ7TPQ3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ShprhQ7TPQ3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ShprhQ7TPQ3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ShprhQ7TPQ3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ShprhQ7TPQ3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ShprhQ7TPQ3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ShprhQ7TPQ3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ShprhQ7TPQ3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ShprhQ7TPQ3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ShprhQ7TPQ3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ShprhQ7TPQ3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ShprhQ7TPQ3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ShprhQ7TPQ3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ShprhQ7TPQ3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ShprhQ7TPQ3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ShprhQ7TPQ3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ShprhQ7TPQ3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ShprhQ7TPQ3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ShprhQ7TPQ3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ShprhQ7TPQ3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ShprhQ7TPQ3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ShprhQ7TPQ3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ShprhQ7TPQ3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ShprhQ7TPQ3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ShprhQ7TPQ3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ShprhQ7TPQ3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ShprhQ7TPQ3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ShprhQ7TPQ3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ShprhQ7TPQ3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ShprhQ7TPQ3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ShprhQ7TPQ3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ShprhQ7TPQ3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ShprhQ7TPQ3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ShprhQ7TPQ3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ShprhQ7TPQ3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ShprhQ7TPQ3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ShprhQ7TPQ3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ShprhQ7TPQ3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ShprhQ7TPQ3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ShprhQ7TPQ3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ShprhQ7TPQ3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ShprhQ7TPQ3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ShprhQ7TPQ3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ShprhQ7TPQ3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ShprhQ7TPQ3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ShprhQ7TPQ3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ShprhQ7TPQ3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ShprhQ7TPQ3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ShprhQ7TPQ3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ShprhQ7TPQ3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ShprhQ7TPQ3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ShprhQ7TPQ3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ShprhQ7TPQ3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ShprhQ7TPQ3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ShprhQ7TPQ3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ShprhQ7TPQ3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ShprhQ7TPQ3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ShprhQ7TPQ3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ShprhQ7TPQ3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ShprhQ7TPQ3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ShprhQ7TPQ3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ShprhQ7TPQ3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ShprhQ7TPQ3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ShprhQ7TPQ3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ShprhQ7TPQ3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ShprhQ7TPQ3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ShprhQ7TPQ3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ShprhQ7TPQ3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ShprhQ7TPQ3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ShprhQ7TPQ3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ShprhQ7TPQ3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ShprhQ7TPQ3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms