Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM3

Trim17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim17Q7TPM3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms