Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN88

Pkd1l2, Polycystic kidney disease protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd1l2Q7TN88 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkd1l2Q7TN88 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms