Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN16

Hhip, Hedgehog-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HhipQ7TN16 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms