Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMS5

Abcg2, ATP-binding cassette sub-family G member 2, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg2Q7TMS5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcg2Q7TMS5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Abcg2Q7TMS5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Abcg2Q7TMS5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms