Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms