Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim12Q78RX3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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