Protein–RNA interactions for Protein: Q76N33

Stambpl1, AMSH-like protease, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stambpl1Q76N33 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Stambpl1Q76N33 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stambpl1Q76N33 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stambpl1Q76N33 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stambpl1Q76N33 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stambpl1Q76N33 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stambpl1Q76N33 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stambpl1Q76N33 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stambpl1Q76N33 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stambpl1Q76N33 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Stambpl1Q76N33 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Stambpl1Q76N33 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Stambpl1Q76N33 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Stambpl1Q76N33 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Stambpl1Q76N33 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Stambpl1Q76N33 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Stambpl1Q76N33 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Stambpl1Q76N33 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Stambpl1Q76N33 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stambpl1Q76N33 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms