Protein–RNA interactions for Protein: Q76KJ5

Cd3eap, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eapQ76KJ5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms