Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SpopQ6ZWS8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SpopQ6ZWS8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SpopQ6ZWS8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SpopQ6ZWS8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SpopQ6ZWS8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SpopQ6ZWS8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SpopQ6ZWS8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SpopQ6ZWS8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SpopQ6ZWS8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SpopQ6ZWS8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SpopQ6ZWS8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SpopQ6ZWS8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SpopQ6ZWS8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SpopQ6ZWS8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SpopQ6ZWS8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SpopQ6ZWS8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SpopQ6ZWS8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SpopQ6ZWS8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SpopQ6ZWS8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SpopQ6ZWS8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SpopQ6ZWS8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SpopQ6ZWS8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SpopQ6ZWS8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SpopQ6ZWS8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SpopQ6ZWS8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SpopQ6ZWS8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SpopQ6ZWS8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SpopQ6ZWS8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SpopQ6ZWS8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SpopQ6ZWS8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SpopQ6ZWS8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SpopQ6ZWS8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SpopQ6ZWS8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SpopQ6ZWS8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SpopQ6ZWS8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SpopQ6ZWS8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SpopQ6ZWS8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SpopQ6ZWS8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SpopQ6ZWS8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SpopQ6ZWS8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SpopQ6ZWS8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SpopQ6ZWS8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SpopQ6ZWS8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SpopQ6ZWS8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SpopQ6ZWS8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SpopQ6ZWS8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SpopQ6ZWS8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SpopQ6ZWS8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SpopQ6ZWS8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SpopQ6ZWS8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SpopQ6ZWS8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
SpopQ6ZWS8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SpopQ6ZWS8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SpopQ6ZWS8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SpopQ6ZWS8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SpopQ6ZWS8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SpopQ6ZWS8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms