Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQM0

Rffl, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfflQ6ZQM0 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RfflQ6ZQM0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms