Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Topbp1Q6ZQF0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Topbp1Q6ZQF0 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Topbp1Q6ZQF0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Topbp1Q6ZQF0 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Topbp1Q6ZQF0 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Topbp1Q6ZQF0 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Topbp1Q6ZQF0 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Topbp1Q6ZQF0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Topbp1Q6ZQF0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Topbp1Q6ZQF0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Topbp1Q6ZQF0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Topbp1Q6ZQF0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Topbp1Q6ZQF0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Topbp1Q6ZQF0 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Topbp1Q6ZQF0 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Topbp1Q6ZQF0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Topbp1Q6ZQF0 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Topbp1Q6ZQF0 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Topbp1Q6ZQF0 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Topbp1Q6ZQF0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Topbp1Q6ZQF0 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Topbp1Q6ZQF0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Topbp1Q6ZQF0 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Topbp1Q6ZQF0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Topbp1Q6ZQF0 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Topbp1Q6ZQF0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Topbp1Q6ZQF0 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Topbp1Q6ZQF0 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms