Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQE4

Nemp1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nemp1Q6ZQE4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms