Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ18

Efr3b, Protein EFR3 homolog B, mousemouse

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Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efr3bQ6ZQ18 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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Efr3bQ6ZQ18 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efr3bQ6ZQ18 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efr3bQ6ZQ18 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Efr3bQ6ZQ18 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Efr3bQ6ZQ18 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Efr3bQ6ZQ18 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
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Efr3bQ6ZQ18 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Efr3bQ6ZQ18 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efr3bQ6ZQ18 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efr3bQ6ZQ18 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efr3bQ6ZQ18 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efr3bQ6ZQ18 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efr3bQ6ZQ18 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efr3bQ6ZQ18 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efr3bQ6ZQ18 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efr3bQ6ZQ18 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efr3bQ6ZQ18 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efr3bQ6ZQ18 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efr3bQ6ZQ18 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efr3bQ6ZQ18 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efr3bQ6ZQ18 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Efr3bQ6ZQ18 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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Efr3bQ6ZQ18 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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Efr3bQ6ZQ18 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Efr3bQ6ZQ18 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efr3bQ6ZQ18 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efr3bQ6ZQ18 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efr3bQ6ZQ18 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efr3bQ6ZQ18 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efr3bQ6ZQ18 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efr3bQ6ZQ18 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efr3bQ6ZQ18 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efr3bQ6ZQ18 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efr3bQ6ZQ18 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efr3bQ6ZQ18 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efr3bQ6ZQ18 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efr3bQ6ZQ18 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Efr3bQ6ZQ18 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Efr3bQ6ZQ18 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efr3bQ6ZQ18 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efr3bQ6ZQ18 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efr3bQ6ZQ18 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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