Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NinlQ6ZQ12 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NinlQ6ZQ12 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NinlQ6ZQ12 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NinlQ6ZQ12 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NinlQ6ZQ12 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NinlQ6ZQ12 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NinlQ6ZQ12 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NinlQ6ZQ12 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NinlQ6ZQ12 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NinlQ6ZQ12 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NinlQ6ZQ12 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NinlQ6ZQ12 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NinlQ6ZQ12 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NinlQ6ZQ12 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NinlQ6ZQ12 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NinlQ6ZQ12 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NinlQ6ZQ12 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NinlQ6ZQ12 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NinlQ6ZQ12 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NinlQ6ZQ12 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NinlQ6ZQ12 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NinlQ6ZQ12 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NinlQ6ZQ12 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NinlQ6ZQ12 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NinlQ6ZQ12 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NinlQ6ZQ12 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NinlQ6ZQ12 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NinlQ6ZQ12 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NinlQ6ZQ12 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NinlQ6ZQ12 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NinlQ6ZQ12 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NinlQ6ZQ12 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NinlQ6ZQ12 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NinlQ6ZQ12 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NinlQ6ZQ12 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NinlQ6ZQ12 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NinlQ6ZQ12 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NinlQ6ZQ12 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NinlQ6ZQ12 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NinlQ6ZQ12 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NinlQ6ZQ12 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NinlQ6ZQ12 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NinlQ6ZQ12 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NinlQ6ZQ12 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NinlQ6ZQ12 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NinlQ6ZQ12 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NinlQ6ZQ12 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NinlQ6ZQ12 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NinlQ6ZQ12 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NinlQ6ZQ12 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NinlQ6ZQ12 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NinlQ6ZQ12 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NinlQ6ZQ12 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NinlQ6ZQ12 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NinlQ6ZQ12 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NinlQ6ZQ12 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NinlQ6ZQ12 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NinlQ6ZQ12 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NinlQ6ZQ12 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NinlQ6ZQ12 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NinlQ6ZQ12 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NinlQ6ZQ12 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NinlQ6ZQ12 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NinlQ6ZQ12 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NinlQ6ZQ12 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NinlQ6ZQ12 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NinlQ6ZQ12 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NinlQ6ZQ12 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NinlQ6ZQ12 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NinlQ6ZQ12 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NinlQ6ZQ12 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NinlQ6ZQ12 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NinlQ6ZQ12 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NinlQ6ZQ12 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NinlQ6ZQ12 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NinlQ6ZQ12 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NinlQ6ZQ12 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NinlQ6ZQ12 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NinlQ6ZQ12 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NinlQ6ZQ12 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NinlQ6ZQ12 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NinlQ6ZQ12 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NinlQ6ZQ12 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NinlQ6ZQ12 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NinlQ6ZQ12 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NinlQ6ZQ12 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NinlQ6ZQ12 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NinlQ6ZQ12 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NinlQ6ZQ12 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NinlQ6ZQ12 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NinlQ6ZQ12 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NinlQ6ZQ12 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NinlQ6ZQ12 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NinlQ6ZQ12 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NinlQ6ZQ12 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NinlQ6ZQ12 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NinlQ6ZQ12 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NinlQ6ZQ12 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NinlQ6ZQ12 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
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