Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ino80Q6ZPV2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ino80Q6ZPV2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ino80Q6ZPV2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ino80Q6ZPV2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ino80Q6ZPV2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ino80Q6ZPV2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ino80Q6ZPV2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ino80Q6ZPV2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ino80Q6ZPV2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ino80Q6ZPV2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ino80Q6ZPV2 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ino80Q6ZPV2 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ino80Q6ZPV2 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ino80Q6ZPV2 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ino80Q6ZPV2 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ino80Q6ZPV2 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ino80Q6ZPV2 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ino80Q6ZPV2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ino80Q6ZPV2 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ino80Q6ZPV2 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ino80Q6ZPV2 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ino80Q6ZPV2 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ino80Q6ZPV2 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ino80Q6ZPV2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ino80Q6ZPV2 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ino80Q6ZPV2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ino80Q6ZPV2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ino80Q6ZPV2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ino80Q6ZPV2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ino80Q6ZPV2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ino80Q6ZPV2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ino80Q6ZPV2 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ino80Q6ZPV2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms