Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms