Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Cxcl3Q6W5C0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Cxcl3Q6W5C0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms