Protein–RNA interactions for Protein: Q6VSS7

Rhox8, Reproductive homeobox 8, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox8Q6VSS7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Rhox8Q6VSS7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Rhox8Q6VSS7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Rhox8Q6VSS7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Rhox8Q6VSS7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Rhox8Q6VSS7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Rhox8Q6VSS7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Rhox8Q6VSS7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Rhox8Q6VSS7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Rhox8Q6VSS7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Rhox8Q6VSS7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Rhox8Q6VSS7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Rhox8Q6VSS7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Rhox8Q6VSS7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Rhox8Q6VSS7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Rhox8Q6VSS7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Rhox8Q6VSS7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Rhox8Q6VSS7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Rhox8Q6VSS7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Rhox8Q6VSS7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Rhox8Q6VSS7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Rhox8Q6VSS7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Rhox8Q6VSS7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Rhox8Q6VSS7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Rhox8Q6VSS7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Rhox8Q6VSS7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Rhox8Q6VSS7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Rhox8Q6VSS7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Rhox8Q6VSS7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Rhox8Q6VSS7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Rhox8Q6VSS7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Rhox8Q6VSS7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Rhox8Q6VSS7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
Rhox8Q6VSS7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Rhox8Q6VSS7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Rhox8Q6VSS7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Rhox8Q6VSS7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Rhox8Q6VSS7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Rhox8Q6VSS7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Rhox8Q6VSS7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Rhox8Q6VSS7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
Rhox8Q6VSS7 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Rhox8Q6VSS7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Rhox8Q6VSS7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Rhox8Q6VSS7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Rhox8Q6VSS7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Rhox8Q6VSS7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Rhox8Q6VSS7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Rhox8Q6VSS7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Rhox8Q6VSS7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Rhox8Q6VSS7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Rhox8Q6VSS7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Rhox8Q6VSS7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Rhox8Q6VSS7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Rhox8Q6VSS7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Rhox8Q6VSS7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Rhox8Q6VSS7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Rhox8Q6VSS7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Rhox8Q6VSS7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Rhox8Q6VSS7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Rhox8Q6VSS7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
Rhox8Q6VSS7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Rhox8Q6VSS7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Rhox8Q6VSS7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Rhox8Q6VSS7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Rhox8Q6VSS7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Rhox8Q6VSS7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
Rhox8Q6VSS7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Rhox8Q6VSS7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Rhox8Q6VSS7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Rhox8Q6VSS7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Rhox8Q6VSS7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Rhox8Q6VSS7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Rhox8Q6VSS7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Rhox8Q6VSS7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Rhox8Q6VSS7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Rhox8Q6VSS7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Rhox8Q6VSS7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Rhox8Q6VSS7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
Rhox8Q6VSS7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Rhox8Q6VSS7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Rhox8Q6VSS7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Rhox8Q6VSS7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Rhox8Q6VSS7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
Rhox8Q6VSS7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Rhox8Q6VSS7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Rhox8Q6VSS7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Rhox8Q6VSS7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Rhox8Q6VSS7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Rhox8Q6VSS7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
Rhox8Q6VSS7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Rhox8Q6VSS7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Rhox8Q6VSS7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Rhox8Q6VSS7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Rhox8Q6VSS7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Rhox8Q6VSS7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Rhox8Q6VSS7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Rhox8Q6VSS7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
Rhox8Q6VSS7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
Rhox8Q6VSS7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms