Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms