Protein–RNA interactions for Protein: Q6V4S5

Sdk2, Protein sidekick-2, mousemouse

Predictions only

Length 2,176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdk2Q6V4S5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms