Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Timd4Q6U7R4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Timd4Q6U7R4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Timd4Q6U7R4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Timd4Q6U7R4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Timd4Q6U7R4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Timd4Q6U7R4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Timd4Q6U7R4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Timd4Q6U7R4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Timd4Q6U7R4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Timd4Q6U7R4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Timd4Q6U7R4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Timd4Q6U7R4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Timd4Q6U7R4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Timd4Q6U7R4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Timd4Q6U7R4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Timd4Q6U7R4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Timd4Q6U7R4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Timd4Q6U7R4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Timd4Q6U7R4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Timd4Q6U7R4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Timd4Q6U7R4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Timd4Q6U7R4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Timd4Q6U7R4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Timd4Q6U7R4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Timd4Q6U7R4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Timd4Q6U7R4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Timd4Q6U7R4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Timd4Q6U7R4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Timd4Q6U7R4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Timd4Q6U7R4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Timd4Q6U7R4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Timd4Q6U7R4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Timd4Q6U7R4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Timd4Q6U7R4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Timd4Q6U7R4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Timd4Q6U7R4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Timd4Q6U7R4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Timd4Q6U7R4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Timd4Q6U7R4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Timd4Q6U7R4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Timd4Q6U7R4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Timd4Q6U7R4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Timd4Q6U7R4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Timd4Q6U7R4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Timd4Q6U7R4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Timd4Q6U7R4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Timd4Q6U7R4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Timd4Q6U7R4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Timd4Q6U7R4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Timd4Q6U7R4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Timd4Q6U7R4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Timd4Q6U7R4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Timd4Q6U7R4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Timd4Q6U7R4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Timd4Q6U7R4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Timd4Q6U7R4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Timd4Q6U7R4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Timd4Q6U7R4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms